Через год после поражения "Воинов Тени", Билли и Джимми Ли угрожает новый враг, таинственная организация похищает Мэрион. Единственный свидетель, умирает, не успев раскрыть настоящую личность их лидера. Гадалка по имени Хируко сообщает братьям Ли, что похитители ищут три Священных Камня Силы, которые были разбросаны по всему миру, и что единственный способ спасти ее - достать их до того, как это сделают похитители.
В игре отсутствует традиционная система здоровья из предыдущих частей для NES, а также магазины предметов из аркадной версии. Вместо этого игрок получает возможность управлять двумя новыми бойцами в дополнение к братьям Ли по мере прохождения игры. Эти дополнительные бойцы присоединяются к группе игрока после того, как они побеждены как вражеские боссы. Чин Сэймэй, мастер китайских боевых искусств и Ягю Ранзо, глава ниндзя. На сайте вы сможете ознакомиться с портом Double Dragon III для Sega Genesis / Mega Drive.